Microbiome

Progresser dans la compréhension du microbiome

Un large panel d’offres de services distinctes et diversifiées

Grâce à ses installations, son environnement et ses collaborations/réseaux, Oncodesign Services peut travailler avec des échantillons précliniques et cliniques (environnement conforme aux BPL/BPLC pour la bioanalyse) et manipuler des microorganismes vivants (laboratoires certifiés P2, P3 et OGM2).

Modèles et Standards:

Oncodesign Services propose des outils adaptés pour mimer des situations saines et pathologiques, étudier les interactions avec le système immunitaire à des fins de dépistage et de preuve de concept:

• Approches expérimentales
  • Co-cultures in vitro 2D & 3D
  • SPF/SOPF, animaux sans germes ou avec un microbiote personnalisé
  • Spécimen biologique humain
• Phénotypage immunitaire
  • Profil de cytokines
  • Infiltrat immunitaire
• Biomarqueurs
  • Perméabilité intestinale (par exemple zonuline)
  • Inflammation (par exemple calprotectine, lipocaline-2)
  • Métabolites (par exemple acides gras à chaîne courte)

Méthodes et analyses pour les études du microbiome

Oncodesign Services propose une large gamme d’approches technologiques pour la culture, la détection, l’identification et la localisation de micro-organismes (bactéries, levures, etc.) dans des échantillons simples ou complexes (fluides, tissus) issus d’études précliniques ou d’essais cliniques.

• Culture / Formulation
  • Culture de bactéries et levures aérobies ou anaérobies
  • Préparation de souche unique ou consortium (avec contrôle qualité des lots)
  • Manipulation de microbes sauvages, modifiés ou dérivés
  • Formulation de produits surgelés, lyophilisés, pasteurisés
• Détection
  • Comptage des UFC
  • qPCR couplée ou non au PMA
• Identification
  • Spectrométrie de masse
  • qPCR/dPCR
  • Séquençage du gène de l’ARNr 16S
  • Séquençage des fusils de chasse
  • Phylopeptidomique
• Localisation
  • Imagerie
  • Culture ex vivo

Prendre en compte le microbiome dans les projets de drug discovery

Plusieurs sujets d’intérêt ont émergé de la recherche sur le microbiome, conduisant à :

• Étudier la relation entre la composition du microbiome et la maladie ciblée
• Définir le rôle du microbiome dans le cadre des diagnostics de précision et des traitements personnalisés
• Développer et évaluer des thérapies du microbiome
• Comprendre l’impact d’un médicament sur le microbiome et l’influence de celui-ci sur la réponse individuelle d’une personne à un médicament.

Oncodesign Services a développé une offre exhaustive qui permet à nos clients d’accéder à des réseaux, plateformes et expertises technologiques et scientifiques à l’appui de leurs projets, notamment pour démontrer le bénéfice sur la santé, évaluer la sécurité et/ou déchiffrer le(s) mécanisme(s) d’action de thérapies basées sur le microbiome ou de médicaments non-microbiens.

Études de cas autour du microbiome

Notre équipe multidisciplinaire conçoit des études sur mesure pour évaluer des thérapies basées sur le microbiome et des interactions médicament-microbiome.

Découvrez ci-dessous quelques exemples d’expériences menées par Oncodesign Services autour du microbiome :

• Dans quelle mesure un traitement par des agents de chimiothérapie influe-t-il sur la composition du microbiote intestinal ?
• Des bactéries peuvent-elles améliorer l’efficacité d’un inhibiteur du checkpoint immunitaire chez des souris « avatar » ?
• Un produit biothérapeutique vivant pourrait-il moduler les réponses immunitaires au niveau du tissu intestinal ou du microenvironnement tumoral ?
• Une colite induite peut-elle être traitée avec une transplantation de microbiote fécal ?
• La dermatite atopique pourrait-elle être soulagée en utilisant une souche unique ?
• Utilisation de la qPCR/dPCR avec du monoazide de propidium (PMA) comme un outil précieux pour quantifier les bactéries vivantes au sein d’échantillons cliniques (fèces, frottis cutanés).

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